Untuk Windows Server 2008 R2 sudah tentu akan dilengkapi dengan service FTP server versi terbaru. Banyak peningkatan di FTP server versi terbaru ini bila dibandingkan dengan versi - versi sebelumnya, diantaranya adalah :
1. Kemudahan dalam mengurus FTP server. FTP server terbaru yang terdapat di
Windows Server R2 ini sudah terintegrasi secara penuh dengan IIS 7.5
dan juga sudah dilengkapi dengan GUI untuk mempermudah setting.

2. Penyesuaian standar internet. Hal ini berkaitan dengan penggunaan FTP via SSL dan menggunakan sistem pengalamatan IPv6.
3. Peningkatan dalam hal integrasi dengan aplikasi dan service web-based. Dengan mengguanakan FTP server ini kita dapat menentukan sebuah virtual hostname untuk sebuah FTP site. Dengan begini kita dapat membuat banyak FTP site hanya dengan menggunakan sebuah ip address saja. Tujuannya kita dapat mem-binding sebuah web site dengan sebuah FTP site, sesuai dengan sistem virtual hostname nya.
4. Kemudahan dalam melakukan troubleshooting. Peningkatan dalam hal logging dimana sekarang support untuk melihat trafik FTP, unique FTP session, dan banyak detail tentang FTP log.